Jedným s možných rizík čerpania prostriedkov z kohézneho a štrukturálnych fondov po vstupe SR do EÚ je to, že štátny rozpočet nebude mať dostatok prostriedkov na spolufinancovanie projektov. Čerpanie veľkej časti prostriedkov z fondov EÚ je však podmienené práve spolufinancovaním z národných zdrojov. "Spolufinancovanie bude veľký problém v oblasti poľnohospodárstva, regionálnej politiky a aj malého a stredného podnikania," povedal v tejto súvislosti vicepremiér pre integráciu Pál Csáky. Prostriedky z eurofondov budú navyše refundované až po predložení faktúr za realizované práce. Ešte predtým bude potrebné získať prostriedky na ich realizáciu. P. Csáky si preto myslí, že by do procesu mali byť zapojené komerčné banky. Navrhuje zriadenie revolvingového fondu, v ktorom by boli prostriedky zo štátneho rozpočtu, komerčných bánk a možno aj Fondu národného majetku (FNM). Financovala by sa z neho realizácia projektov, pričom by sa do neho vracali refundované peniaze z eurofondov. Iný názor má podľa P. Csákyho minister financií Ivan Mikloš, ktorý preferuje využívanie prostriedkov FNM. "O tejto otázke ešte budeme diskutovať. Spoločný návrh máme vláde predložiť do konca júla," uviedol P. Csáky.